El agua es uno de los principales factores que determinan el desarrollo de la vida dentro de los ecosistemas; dentro del bosque, las plantas determinan la cantidad de agua que es acumulada por un ecosistema y a su vez estas ayudan a atraer las nubes hacia nuestro entorno, por ello es importante mantener un equilibrio entre la flora de cualquier ecosistema.

Desde Agosto de 1998, el entonces llamado departamento de Vida Silvestre del Parque Ecológico Chipinque (ahora Departamento de Investigación y Manejo de Recursos Naturales), mostró una preocupación por conocer el estado físico-químico   y microbiológico del agua que se encuentra en los veneros del Parque y que es utilizada para consumo humano.

Dentro del Parque Ecológico Chipinque contamos con diez   veneros, de los cuales utilizamos para consumo humano solo tres: el de Joyas del venado, el Tanque cuatro y el Socavón; estos tres veneros abastecen de agua a los bebederos de CAV, Km2, Canoas, Explanada, Meseta, Delicias y Puerto del aire; que se encuentran dentro del área de visitación del parque.

Se han realizado monitoreos en los años de 1998, 1999, 2000, 2001, 2003, 2004 y 2005 y se cuenta con el registro adecuado, en el cual se indica que no hay presencia de bacterias que afecten la calidad del agua con la que contamos.

Dentro de la Secretaria de Salud en México contamos con la Norma NOM-127-SSA1-1994 en la cual se mencionan los limites permisibles de calidad en agua potable para consumo humano y es importante destacar que a pesar de que no existe una Norma para agua de manantiales y a pesar de esto los veneros del parque se encuentran dentro de la Norma que es para el agua potable destinada a la ciudad.